MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CAGA	2	8	54	61	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009790	CGT	2	6	96	101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009790	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009790	CCT	2	6	294	299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009790	AAT	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009790	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009790	CAC	2	6	366	371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009790	A	6	6	376	381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009790	GCC	2	6	528	533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009790	ACT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009790	CATT	2	8	598	605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009790	CCTGT	2	10	628	637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009790	GACA	2	8	639	646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009790	GCG	2	6	668	673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009790	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009790	ACC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009790	CCCT	2	8	761	768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009790	GCCCC	2	10	784	793	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_009790	TGT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009790	CAT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009790	CTGG	2	8	868	875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009790	TCG	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009790	CGG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009790	GCC	2	6	1111	1116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009790	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009790	TCA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009790	T	6	6	1276	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009790	C	7	7	1287	1293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_009790	CTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009790	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009790	GCC	2	6	2036	2041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009790	AAATC	2	10	2058	2067	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009790	CT	4	8	2068	2075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009790	GCCC	2	8	2083	2090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009790	T	6	6	2099	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009790	TA	3	6	2133	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009790	A	7	7	2154	2160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009790	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009790	AATTT	2	10	3425	3434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009790	AT	3	6	3447	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009790	GTCTG	2	10	3481	3490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009790	TCC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009790	A	6	6	6851	6856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009790	CAC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009790	TTC	2	6	6875	6880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009790	TGAT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009790	T	6	6	6959	6964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009790	T	6	6	7533	7538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009790	AGCCGC	2	12	7564	7575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009790	TCGA	2	8	7588	7595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009790	A	6	6	7621	7626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009790	CAC	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009790	TTC	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009790	TGAT	2	8	7703	7710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009790	T	6	6	7729	7734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009790	TCG	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009790	CCGCC	2	10	9925	9934	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_009790	GCA	2	6	9947	9952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009790	CAA	2	6	11123	11128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009790	GC	3	6	11190	11195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009790	ATG	2	6	11209	11214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009790	GGT	2	6	11252	11257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009790	TG	3	6	11270	11275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009790	ACA	2	6	11338	11343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009790	GAA	2	6	11378	11383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009790	GT	4	8	11417	11424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009790	GT	3	6	11430	11435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009790	GGC	2	6	11513	11518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009790	GGCG	2	8	11556	11563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009790	GCT	2	6	11624	11629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009790	AAC	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009790	GCG	2	6	11734	11739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009790	ATCAC	2	10	11783	11792	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009790	ATT	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009790	CAT	2	6	11817	11822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009790	CCTT	2	8	11838	11845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009790	CTG	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009790	CAT	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009790	GCA	2	6	12428	12433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009790	CGA	2	6	12434	12439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009790	AG	4	8	12448	12455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009790	ATC	2	6	12478	12483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009790	GTT	2	6	12515	12520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009790	GGAA	2	8	12524	12531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009790	TTAC	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009790	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009790	GTCT	2	8	12759	12766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009790	CAA	2	6	12801	12806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009790	GAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009790	GAA	2	6	12946	12951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009790	CAC	2	6	12990	12995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009790	AGG	2	6	13022	13027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009790	GCA	2	6	13092	13097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009790	GCAA	2	8	13139	13146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009790	CCT	2	6	13169	13174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009790	CAGG	2	8	13190	13197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009790	GCTG	2	8	13251	13258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009790	GTA	2	6	13270	13275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009790	GAG	2	6	14934	14939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009790	TACTC	2	10	14974	14983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009790	CGT	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009790	CCAT	2	8	15132	15139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009790	AAG	2	6	15192	15197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009790	GTGG	2	8	15340	15347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009790	CGA	2	6	15362	15367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009790	CTC	2	6	15390	15395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009790	GCAGAA	2	12	15398	15409	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009790	TTA	2	6	15415	15420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009790	GAT	2	6	15437	15442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009790	AAG	2	6	15499	15504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009790	TC	3	6	15643	15648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009790	TGA	2	6	15662	15667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009790	TGC	2	6	15692	15697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009790	ATT	2	6	15774	15779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009790	ACA	2	6	17820	17825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009790	GCA	2	6	17896	17901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009790	GCG	2	6	17948	17953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009790	CT	3	6	17988	17993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009790	CAAT	2	8	18053	18060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009790	GCA	2	6	18112	18117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009790	AAC	2	6	18168	18173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009790	ATC	2	6	18212	18217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009790	TCA	2	6	18305	18310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009790	CCCGT	2	10	18370	18379	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_009790	CCG	2	6	18382	18387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009790	GCCGC	2	10	18420	18429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_009790	GCCC	2	8	18494	18501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009790	GGA	3	9	19543	19551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009790	ACG	2	6	19552	19557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009790	GAG	2	6	19572	19577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009790	GCGACA	2	12	19582	19593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009790	TGT	2	6	19676	19681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009790	CAG	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009790	ACG	2	6	19755	19760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009790	ACA	2	6	19869	19874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009790	TAA	2	6	19898	19903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009790	CGA	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009790	AG	3	6	19937	19942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009790	AAG	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009790	TTA	2	6	22324	22329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009790	CGC	2	6	22341	22346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009790	AGCG	2	8	22365	22372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009790	AGA	2	6	22390	22395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009790	AAG	2	6	22429	22434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009790	AC	3	6	22470	22475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009790	TAA	2	6	22495	22500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009790	TCA	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009790	ATG	2	6	22524	22529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009790	ATC	2	6	22709	22714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009790	ATA	2	6	22730	22735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009790	GGA	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009790	TCG	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_009790	CTT	2	6	22954	22959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_009790	GACG	2	8	23025	23032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_009790	GAGTA	2	10	23168	23177	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009790	CTC	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_009790	GTAA	2	8	25441	25448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009790	T	6	6	37847	37852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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